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Titre : | Bacilles à Gram négatif non fermentants (2022) |
Auteurs : | C. Legouge ; S. Vimont ; J.-W Decousser ; G. Royer |
Type de document : | Article |
Dans : | EMC Biologie médicale (Vol. 17, n° 3, 2022) |
Article en page(s) : | [90-05-0020-A] |
Langues: | Français |
Descripteurs : |
HE Vinci Bactéries ; Génomique ; Taxonomie |
Mots-clés: | Opportuniste ; Strenotrophomonas ; Achromobacter ; Elisabethkingia |
Résumé : | Les bacilles à Gram négatif non fermentants sont des bactéries de lenvironnement responsables dinfections opportunistes chez les patients immunodéprimés. En plus de leur multirésistance naturelle aux antibiotiques, des mécanismes acquis peuvent être observés. La taxonomie de ces genres bactériens a évolué en parallèle des progrès technologiques. Le séquençage des génomes permet aujourdhui dappréhender les schémas évolutifs. Ladaptation de certaines souches à lHomme constitue par ailleurs un modèle détude pour corréler les modifications génétiques avec déventuelles conséquences phénotypiques. Au-delà des genres Pseudomonas et Acinetobacter, dautres genres bactériens émergent au cours dinfections aiguës survenant chez des patients immunodéprimés et/ou porteurs de dispositifs invasifs, ou lors dinfections chroniques chez les patients atteints de mucoviscidose; Stenotrophomonas, Achromobacter et Elisabethkingia constituent ainsi des genres bactériens émergeant dintérêt. Lanalyse phylogénétique basée sur le génome complet permet davoir une approche taxonomique fine: ainsi Stenotrophomonas maltophilia est en fait un complexe despèces, de sous-espèces et/ou de genospecies, dont certaines sont retrouvées plus fréquemment chez lHomme, chez lanimal ou dans lenvironnement. La corrélation des fonds génétiques avec les propriétés de virulence, résistance, fitness et voies métaboliques reste à élucider. Cela concerne en particulier les souches du genre Elisabethkingia responsables de méningites néonatales. Lévolution des connaissances liées à ces genres et espèces est néanmoins limitée par la capacité des bases de données matrix assisted laser desorption ionizationtime of flight (MALDI-TOF) utilisées au quotidien pour les identifier. De plus, il est difficile de corréler les publications anciennes avec la taxonomie actuelle. Les études permettant dévaluer comparativement la place de ces nouveaux microorganismes au sein dune entité clinicobiologique bien définie doivent être préférées aux séries de cas cliniques. |
Disponible en ligne : | Oui |
En ligne : | https://www-clinicalkey-com.ezproxy.vinci.be/now/fr/content/51-s2.0-S2211969822420930 |