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Titre : | Etude des bactériocines pour lutter contre les bactéries pathogènes cutanées |
Auteurs : | Nawal Lefrarni, Auteur ; Pascal Hols, Promoteur ; Denis Dereinne, Promoteur |
Type de document : | Travail de fin d'études |
Editeur : | Woluwe-Saint-Lambert : Haute École Léonard de Vinci, 2023 |
Langues: | Français |
Index. décimale : | TFE - Biologie médicale |
Mots-clés: | Résistance aux antibiotiques ; Agents antimicrobiens ; Bactériocines de classe II ; BlpK ; Mutagenèse aléatoire ; Banque de mutants ; Relation structure/fonction ; Plateforme d'évolution dirigée. |
Résumé : | Ce travail de fin d'études se concentre sur la recherche d'une alternative aux antibiotiques pour combattre les pathogènes cutanés, tels que Staphylococcus aureus et Streptococcus pyogenes. Étant donné l'émergence croissante de résistances aux antibiotiques, il est essentiel de trouver de nouveaux traitements. Parmi les alternatives proposées, les bactériocines, des peptides antimicrobiens produits par les bactéries, sont considérées comme prometteuses. L'étude se focalise sur la bactériocine BlpK, de classe II, produite par Streptococcus salivarius HSISS4, qui présente une activité inhibitrice contre les pathogènes cibles, bien que faible pour S. aureus. Une première étape a consisté à étudier la relation structure-fonction de BlpK par mutagenèse aléatoire. Une banque de mutants de BlpK a été créée, bien que le nombre de mutants obtenu soit inférieur aux attentes. Certains mutants ont montré un phénotype de "grande colonie" tout en conservant leur activité bactériocine. Quatre mutants ont été sélectionnés pour une analyse plus approfondie de leur relation structure-fonction. Parallèlement, une plateforme d'évolution dirigée des bactériocines a été développée. Différentes méthodes de criblage ont été testées, et une méthode a été mise en place, permettant d'identifier des colonies produisant un halo d'inhibition. Cependant, l'utilisation de la souche productrice sans immunité associée peut limiter la détection de phénotypes intéressants, et des améliorations seront nécessaires pour optimiser cette méthode.Pour approfondir les recherches, il est recommandé de constituer une banque de mutants plus étendue pour une meilleure diversité. Une analyse approfondie des mutants sélectionnés, incluant du séquençage à haut débit (NGS), permettrait den apprendre davantage sur la relation structure-fonction de BlpK. Concernant la plateforme d'évolution dirigée, des améliorations seront nécessaires pour optimiser le criblage et développer une souche présentant une résistance globale aux bactériocines. L'utilisation de critères visuels dans les tests et l'exploration d'autres classes de bactériocines pourraient également être envisagées. En conclusion, ce travail de fin d'études a permis des avancées significatives dans l'étude de la relation structure-fonction de BlpK et le développement d'une plateforme d'évolution dirigée des bactériocines. L'objectif final est de sélectionner des bactériocines plus efficaces contre S. aureus et S. pyogenes, ouvrant la voie au développement de nouvelles thérapies pour lutter contre ces infections. |
Accès : | Identifiez-vous avant d'accéder au document électronique |
Disponible en ligne : | Oui |
Lieu du stage : | UCLouvain-LIBST/BGM (Biochemistry and Genetics of Microorganisms) |
Département : | Biologie médicale |
Documents numériques (1)
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