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Titre : | Investigation dune épidémie à bactéries productrices de carbapénémase dans une unité de soins intensifs. |
Auteurs : | Beysa Guler, Auteur ; AHALIEYAH Anantharajah, Promoteur |
Type de document : | Travail de fin d'études |
Editeur : | Woluwe-Saint-Lambert : Haute École Léonard de Vinci, 2023 |
Langues: | Français |
Index. décimale : | TFE - Biologie médicale |
Mots-clés: | Pseudomonas aeruginosa ; Épidémie ; Infections associées aux soins ; Carbapénémases ; Séquençage du génome complet |
Résumé : |
Les infections associées aux soins de santé́ causées par des bactéries résistantes aux carbapénèmes sont une préoccupation majeure, en particulier dans les unités de soins intensifs (SIM) où les patients immunodéprimés sont particulièrement vulnérables. Depuis 2017, une épidémie de Pseudomonas aeruginosa (Pa) resistant aux carbapénèmes a touché́ les SIM des Cliniques universitaires Saint-Luc, ce qui est alarmant étant donné le manque dantibiotiques efficaces pour traiter ces infections. À la suite de lanalyse phénotypique, les siphons dévier ont été suspectés de contribuer à la propagation de ces bactéries, en raison de la présence de souches similaires dans les siphons dévier et chez les patients infectés. Lobjectif principal est dinvestiguer sur cette épidémie en déterminant les similarités génétiques entre les souches provenant des SIM et danalyser le rôle potentiel des siphons dévier dans la transmission de ce pathogène. Pour identifier les similitudes et les différences, le séquençage complet du génome (WGS) a été réalisé́ sur 60 isolats, comprenant des échantillons de siphons dévier, de patients séjournant au SIM et dautres unités. Lanalyse des données de séquençage a fourni plusieurs informations. Tout
dabord, lanalyse des gènes de résistance a révélé la présence de mécanismes de résistance communs parmi les souches étudiées. De plus, lanalyse MLST a permis dobtenir des indications préliminaires sur la parenté génétique en attribuant une combinaison spécifique dallèles, connue sous le nom de séquence type (ST), regroupée en groupe ou complexe clonaux. Ensuite, sur base de lanalyse wgMLST, un arbre phylogénétique a été réalisé́, ce qui a définitivement déterminé́ la similarité́ génétique entre les souches. Parmi les souches suspectées, 33 ont été identifiées comme faisant potentiellement partie de la même chaine de transmission, dont 16 provenant de patients et 17 des siphons dévier. En conclusion, létude a confirmé́ la transmission de Pa résistant aux carbapénèmes entre les patients et les siphons dévier des SIM. Les souches présentaient un degré́ élevé́ de similarité́ génétique, avec le type de séquence ST111 comme prédominant. Ces souches portaient un gène codant pour la carbapénémase VIM-2. Comprendre les caractéristiques génétiques et la dynamique de transmission de ces souches est essentiel pour mettre en place des mesures efficaces de lutte contre les infections et protéger la santé des patients. |
Accès : | Identifiez-vous avant d'accéder au document électronique |
Disponible en ligne : | Oui |
Lieu du stage : | UCLouvain-IREC-Pôle de Microbiologie |
Département : | Biologie médicale |
Documents numériques (1)
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