| Titre : | Validation des milieux de culture pour le dépistage du portage de MRSA, ESBL et CPE |
| Auteurs : | Semiha Bilgili, Auteur ; Véronique Yvette Miendje Deyi, Promoteur |
| Type de document : | Travail de fin d'études |
| Editeur : | Woluwe-Saint-Lambert : Haute École Léonard de Vinci, 2022 |
| Langues: | Français |
| Index. décimale : | TFE - Biologie médicale |
| Descripteurs : |
HE Vinci Diagnostic ; Infection croisée ; Staphylococcus aureusAutres descripteurs beta-lactamase |
| Mots-clés: | Staphylococcus aureus résistant à la méticilline ; Bêta-lactamase à Spectre Etendu ; Enterobacteriaceae résistantes aux carbapénèmes |
| Résumé : |
L'objectif principal d'un laboratoire de microbiologie clinique est de poser un diagnostic afin de déterminer un traitement, mais il contribue également à la prévention des infections associées aux soins, parmi lesquelles MRSA (Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline), ESBL (β-lactamase à spectre étendu) et CPE (entérobactéries productrices de carbapénémase) sont des sujets brûlants. Cette étude vise à réaliser une analyse comparative des milieux de culture BioMérieux chromIDTM MRSA, chromIDR ESBL agar et chromIDR CARBA SMART agar avec respectivement BD BBLTM CHROMagar MRSA II, BBLTM CHROMagar ESBL et BBLTM CHROMagar CPE.
Cette étude comporte trois étapes principales : l’ensemencement, l'incubation et la lecture & identification. Les échantillons sont ensemencés manuellement en parallèle sur les milieux de culture chromogènes BioMérieux et BD dans des conditions de routine. L'incubateur du système d'automatisation de laboratoire BD KiestraTM (TLA) est utilisé pour l'incubation des milieux de culture. La lecture est effectuée digitalement à partir du programme "ReadA Browser". Enfin, le MALDI-TOF MS est utilisé pour l’identification des colonies. En cas de résultats discordants entre les milieux comparés, des tests supplémentaires sont effectués : un antibiogramme pour S. aureus, un test à double disque pour ESBL et un test rapide immunochromatographique pour CPE. À la fin de l'évaluation, nous suggérerons les milieux les plus appropriés pour la routine en fonction de plusieurs paramètres : performances analytiques {VPP (valeur prédictive positive), VPN (valeur prédictive négative), sensibilité et spécificité} en cas de discordance, la facilité de lecture, les tests supplémentaires/coûts et les problèmes techniques. L'objectif est d'inclure dans l'étude 800 échantillons pour le dépistage de MRSA, 600 pour le dépistage de ESBL et 500 pour le dépistage de CPE. Aucune discordance n'est observée pour les 939 milieux de culture MRSA comparés, mais il y a une facilité de lecture significative pour les milieux de culture de BD et moins de tests inutiles. Pour les 568 milieux de culture ESBL comparés, plusieurs cas discordants ont été observés. Pour les milieux BioMérieux, une VPP de 95,7%, une VPN de 97,8%, une sensibilité de 92,4% et une spécificité de 98,6% ont été obtenues, contre respectivement 98,5%, 99,3%, 97,7% et 99,5% pour les milieux BD. Pour les 194 milieux de culture CPE comparés, plusieurs cas discordants ont également été observés. Pour les milieux BioMérieux, une VPP de 100%, une VPN de 98,2%, une sensibilité de 89,7% et une spécificité de 100% ont été calculées. Pour les milieux BD, une VPP de 80,6%, une VPN de 96,5%, une sensibilité de 79,3% et une spécificité de 95,8% ont été calculées. Un gain de sensibilité a également été observé pour les milieux ESBL et CPE lorsque les milieux étaient incubés 48h au lieu de 18h. En conclusion, les milieux de culture BD MRSA seront utilisés en routine en raison de leur facilité de lecture. Le milieu de culture BD ESBL sera utilisé, car il offre de meilleures performances analytiques. D'autre part, malgré un nombre réduit d'échantillons inclus ( sera probablement poursuivie pour le criblage des CPE. Par ailleurs, cette étude a également permis de modifier le temps d'incubation des milieux BLSE et CPE qui seront désormais incubés pendant 48 heures afin d'augmenter leur sensibilité |
| Accès : | Identifiez-vous avant d'accéder au document électronique |
| Disponible en ligne : | Oui |
| Lieu du stage : | CHU- Saint Pierre, LHUB-ULB Porte de Hal |
| Département du TFE : | Biologie médicale |
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