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Titre : | La protéomique quantitative par la méthode SILAC : technique et perspectives (2009) |
Auteurs : | A. Emadali ; M. Gallagher-Gambarelli ; Collectif |
Type de document : | Article |
Dans : | Médecine/Sciences (25, n° 10, 2009,) |
Article en page(s) : | pp. 835-842 |
Descripteurs : |
HE Vinci Protéomique |
Résumé : | Les approches de protéomique quantitative basées sur la spectrométrie de masse sont parfaitement adaptées à la détection de changements au niveau protéique entre échantillons biologiques. Parmi ces techniques, la méthode SILAC (stable isotope labelling by amino acids in cell culture) a démontré un réel potentiel. Cette méthode s avère en effet être précise et relativement simple à mettre en uvre pour quantifier les protéines extraites de cellules en culture. Le principe est le suivant : les cellules sont cultivées dans un milieu contenant soit des acides aminés naturels (synthèse de protéines « légères »), soit leurs équivalents isotopiquement marqués (synthèse de protéines « lourdes »). Les populations cellulaires à comparer sont mélangées et traitées comme un seul échantillon, ce qui permet de préparer les protéines d intérêt sans risquer d introduire des erreurs de quantification. Au cours de l analyse par spectrométrie de masse, l abondance relative entre les échantillons biologiques peut être calculée pour chaque protéine en comparant l intensité des peptides légers et lourds. Comme le montrent ses applications à diverses problématiques biologiques et cliniques, la méthode SILAC est particulièrement prometteuse pour l élucidation des mécanismes moléculaires impliqués dans les grandes fonctions cellulaires, ainsi que pour l identification de biomarqueurs de maladies. La limitation de la méthode SILAC à la quantification de protéines issues de cellules en culture vient d être levée suite à la description d une souris SILAC dont toutes les protéines sont marquées isotopiquement. Ces travaux laissent présager une extension de cette stratégie analytique à l étude différentielle de tissus et de fluides biologiques d animaux modèles. |
Disponible en ligne : | Non |
Exemplaires (1)
Cote | Support | Localisation | Section | Disponibilité |
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REV | Périodique papier | Woluwe | Espace revues | Consultation sur place uniquement Exclu du prêt |